S> Наклёвывается весьма интересная вещь — CodeCompare, если в следующей бете наконец починят глючащий детект регионов — добавлю в список.
Для Visual Studio 2010 действительно был баг с определением положения регионов, уже пофикшено. Если вы имеете в виду синхронизацию скроллов, то теперь есть возможность её отключать (совсем или удерживая SHIFT).

S> У CodeCompare слегка страшный вид, но после настройки (см. скриншоты) — терпимо.
Скриншоты с CodeCompare я не нашел. Если это всё-таки о нём, то сейчас есть возможность настройки цветов. Какие еще улучшения вы хотели бы видеть?

Доступна версия 1.00.8 — http://www.devart.com/codecompare/download.html
Пишите свои отзывы и пожелания.